Игру как минимум три раза придется пройти, ибо там огромный такой кусок сюжета нового открывается после первого прохождения, плюс новые важные персонажи появляются, а старые в свою очередь раскрываются с другой стороны. У Йоко Таро все игры такие, первое прохождение это дай бог только треть игры. Чтобы знать весь сюжет придется проходить несколько раз.
Об этом уже писали во многих обзорах, на канобу к примеру даже две рецензии было, одна на первое прохождение, другая на многократное:
Обзор первого прохождения
Рецензия на вторую половину NieR: Automata