Хм... у меня геймпад нормально распознался (Logitech RumblePad 2 под эмулятором v2.0.2.90, XInput 3.2.0.295). Просто, геймпады надо принудительно включать в настройках игры (т.е. в настройках выбираешь - либо управление геймпадом, либо клава+мышь, совместно нельзя).